Transfer-Lernen für die Klassifikation medizinischer Texte
Bruneß, D. et al. (2025). Transfer-Lernen für die Klassifikation medizinischer Texte.
Lebenslauf
Ausbildung
- B.Sc. Bioinformatik, Goethe Universität, 2011 – 2015
Bioinformatische Analyse von Proteinstrukturkomplexen mit graphentheoretischen Methoden - M.Sc. Bioinformatik, Goethe Universität, 2015 – 2017
Bioinformatische Netzwerkanalyse und Vergleich des Ubiquitinoms und Phosphoproteoms Salmonella-infizierter Zellen - Ph.D. Informatik, Goethe Universität, 2019 – 2026 (erwartet)
Ontologiebasiertes Transferlernen
Zertifizierungen
- EF Standardized English Test: C2 Proficient (EFSET 75/100), 2017
- CITI Program: Data or Specimens Only Research, 2022
Berufserfahrung
- 01/2024 (laufend) Freiberuflicher Software-Entwickler
- Individualsoftware und wissenschaftliche Recherche
- 11/2023 (laufend) Transferbeauftragter @ hessian.AI, Technische Hochschule Mittelhessen, Friedberg
- Bindeglied zwischen Wissenschaft und Wirtschaft
- Beratung, Wissensaustausch und Koordinierung von Forschungsprojekten
- Verfassen von Forschungsanträgen
- Dozent an der THM
- 11/2019 (laufend) Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Technische Hochschule Mittelhessen, Friedberg
- Betreuung von Studierenden bei Bachelor- und Masterarbeiten
- Betreuung von Studierenden während Praktika
- Planung und Durchführung des Moduls “Applied Natural Language Processing”
- Koordination des LOEWE3-Projekts “Transfer Learning for Medical Diagnosis (TLDia)”
- Forschung und Entwicklung im LOEWE3-Projekt
- 10/2017 – 11/2019 Entwickler, 2VizCon GmbH, Frankfurt am Main
- Webbasierte App-Frontend-Entwicklung in JS und HTML
- Entwurf und Entwicklung diverser Backend-Lösungen in PHP mit MySQL, Neo4j und CouchDB
- Entwurf und Entwicklung von Schnittstellen zwischen Kundenanwendungen und externen APIs (Salesforce, SAP)
- Verarbeitung und Analyse kundenspezifischer Daten
- Weiterentwicklung der firmeneigenen Infrastruktur
- Linux-Serveradministration und Logfile-Analyse
- Unterstützung im Projektmanagement
- Koordination von Werkstudenten
- Schulung von Kunden
- 05/2016 – 10/2017 Werkstudent, 2VizCon GmbH, Neu-Isenburg
- Webbasierte App-Frontend-Entwicklung
- Wartung und Weiterentwicklung diverser Backend-Lösungen
- Pflege von App-Inhalten und Texten
- 2012 – 2016 SEO & Datentypist, HolzLand Becker GmbH & Co. KG, Offenbach
Sprachen
- Deutsch (Muttersprache)
- Englisch (verhandlungssicher / C2)
Forschungsprojekte
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2025 (laufend) InNa – Intelligente Nabelklemme
Nicht-invasives kabelloses Monitoring von Vitalwerten Neugeborener mittels intelligenter Nabelklemme mit KI-basiertem Edge Computing
Gefördert durch Hessisches Ministerium für Digitalisierung und Innovation (Distr@l) -
2026 (laufend) RareNavigator
KI-gestütztes Matchmaking- und Navigationstool für Stakeholder seltener Erkrankungen
Gefördert durch BMWK (Innovationsprogramm für Geschäftsmodelle und Pionierlösungen) -
2026 (laufend) FörderKompass
KI-gestütztes Matching und Antragsbegleitung für KMUs, Impact-Unternehmen und Berater:innen zur Steigerung der Fördermittelnutzung
Gefördert durch BMWK (Innovationsprogramm für Geschäftsmodelle und Pionierlösungen) -
2019 – 2023 Transfer Learning for Medical Diagnosis (TLDia)
LOEWE3-Projekt
Publikationen
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A Hybrid AI-Based Method for ICD Classification of Medical Documents
Bruneß, D., Bay, M., Schulze, C., Guckert, M., & Minor, M. (2023). A Hybrid AI-Based Method for ICD Classification of Medical Documents. Healthcare Transformation with Informatics and Artificial Intelligence, 305, 1-4..
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An Ontology-based transfer learning method improving classification of medical documents.
Bruneß, D., Bay, M., Schulze, C., Guckert, M., & Minor, M. (2022). An Ontology-based transfer learning method improving classification of medical documents. 2022 21st IEEE International Conference on Machine Learning and Applications (ICMLA), 407-412.
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Term Extraction from Medical Documents Using Word Embeddings
Bay, M., Bruneß, D., Herold, M., Schulze, C., Guckert, M., & Minor, M. (2020). Term Extraction from Medical Documents Using Word Embeddings. 2020 6th IEEE Congress on Information Science and Technology (CiSt), 328-333.
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Interacting Spider Webs
Rieser, J., Bruneß, D., Ackermann, J., Koch, I. (2020). Interacting Spider Webs. In: Matthäus, F., Matthäus, S., Harris, S., Hillen, T. (eds) The Art of Theoretical Biology. Springer
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The new protein topology graph library web server
Schäfer, T., Scheck, A., Bruneß, D., May, P., & Koch, I. (2016). The new protein topology graph library web server. Bioinformatics, 32 3, 474-6 .
Vorträge
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A Hybrid AI-based Method for ICD Classification of Medical Documents
Conference Talk at ICIMTH '23 — 21st International Conference on Informatics, Management, and Technology in Healthcare, Athens, Greece